海洋學門資料庫在水文與化學資料方面的任務是蒐集及處理海洋研究船和其他海洋調查產出之大量探測數據，主要是由國內三艘海洋研究船配備的鹽溫深儀(Conductivity-Temperature-Depth Profiler，簡稱CTD)所得的資料所構成，從1985年至今為止，三艘研究船總計執行超過5500個水文航次。綜合這些資料，依據資料分布密度繪製臺灣周圍海域溫度及鹽度圖，提供國內學術研究或工程之環境調查使用，而CTD資料可開放申請的最細項目為每公尺深度之水文及化學資料，提供學門研究計畫申請使用。
本網站說明水文與化學之資料來源、處理方法及程序與資料品管等，最後則展示臺灣周邊水文基本統計結果。欲申請數據資料或圖檔可透過資料申請程序下載水文及化學資料申請單，由專人為您服務。提供的服務如空間範圍及時間區間或特定航次數據資料，其他需求如繪製各式溫度、鹽度圖。
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