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[簡介] BioViewer - ODB生物資訊入口網

發佈日期:2025-08-20 | 最後更新:2025-08-20

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ODB 於今年中正式推出全新 Web APP — ODB 生物資訊服務入口網 BioViewer

BioViewer 以出現紀錄資料為主體,串聯 ODB 既有的生物資訊服務 Key to the Calanoid CopepodsZooplankton Species Overview Hidy Viewer 2,並建置支援學名與俗名的友善查詢系統。讓使用者能直接在 BioViewer 查找、提供簡潔的資料檢視介面和資料下載服務,也可進一步連結至多個相關外部資源。此文將分為三個段落,帶您認識 BioViewer:

網站初覽 | 類群查詢(查詢指南) | 展示介面

網站初覽

BioViewer 是以 ODB 生物海洋資料庫為核心打造的查詢平台,僅能查詢資料庫已收錄的物種。若您是初次使用我們的生物資訊服務,建議先參閱下列的介紹頁面(圖1),快速瞭解 BioViewer 和資料庫:

  • 出現紀錄資料 提供資料庫簡介和使用 BioViewer 的查詢小提示。
  • 收錄類群 開放使用者選擇有興趣的資料主題,並指定一個階層,將列出隨機 10 個有收錄的範例類群,點選任一類群即可前往該類群的展示介面(圖2)。
  • 資料來源 條列生物資料庫的資料來源與佔比。
  • 資料主題 展示資料庫目前已收錄的資料主題簡介和各主題的資料統計。如點選圖示 可於 Hidy Viewer 2 上查看該主題的樣點分布;點選圖示  則可以跳至收錄類群頁面查看該主題的範例物種(圖3)。💡
  • 資料引用 說明本站的資料引用辦法。
圖1、前往介紹頁面
圖2、收錄類群頁面
圖3、資料主題頁面

類群查詢

來到首頁,在搜尋列輸入類群名稱便可進行查詢(詳見下方查詢指南。本站預設的查詢方式為所有包含輸入字串的結果,不限學名或俗名,也不限物種分類階層,若需要調整相關設定,可點搜尋欄左側圖示開啟進階選項(圖4)。

輸入關鍵字後按下 Enter 鍵(或點擊搜尋欄右側的放大鏡圖示)即可送出查詢、自動跳轉到查詢結果頁面。頁面上方會顯示本次查詢輸入的字串與進階選項設定,下方則為搜尋結果表(若點選各欄位表頭可將結果排序,往下滾動至表格底部可以切換頁數),選擇您感興趣的類群,即可前往其展示介面(圖5)。

圖4、搜尋欄與熱門關鍵字

🔎 查詢指南

  • 若是初次來到本站,暫無特定搜尋目標,可以先前往資料主題收錄類群頁面,瞭解資料庫收錄的資料範圍和瀏覽範例類群,或直接點選搜尋欄下方熱門搜尋關鍵字,查看熱門類群(圖4)。
  • 本站雖支援俗名查詢,但仍建議最終依學名查詢來找到正確的資料。由於本站的俗名是比對 TaiCOLWoRMS 所收錄的俗名資料,但俗名往往多樣而超乎想像。比如,想要在本站找海豚的資料,若直接輸入「海豚」來找,查詢結果顯示包含「白斑笛鯛」、「隆背笛鯛」,因其兩者的俗名又為「海豚哥」;此時建議點選一個實際為海豚的類群(例如「真海豚」),前往其展示介面並開啟資訊欄的「分類」(詳見展示介面,點選海豚科的學名 Delphinidae,如此便可前往 Delphinidae 頁面查看資料庫中所有海豚科的資料。
  • 與上述同理,雖然我們有將出現紀錄依資料主題分類,但這些主題名稱(例:仔稚魚、浮游動物)並非特定類群的俗名,因此若直接以「仔稚魚」、「浮游動物」來查詢的話,是無法找到該主題相應資料的。如對特定主題的資料感興趣可以於收錄類群頁面依主題查看涵蓋類群

圖5、搜尋結果頁

展示介面

在類群展示頁面中,可以分為上層的資訊欄和下層的資料儀表板

資訊欄包含多個分頁,提供物種的基本資訊概覽、俗名、分類以及外部連結。如果該物種有收錄於 Key to the Calanoid CopepodsZooplankton Species Overview,則會顯示前往以上資訊服務的按鈕(圖6)。💡

圖6、展示介面資訊欄

資料儀表板可以由上至下再分為展示區進階篩選區資料預覽區

  • 展示區 顯示出現紀錄資料筆數、資料組成圓餅圖、時間分布長條圖和地理分布小地圖。將滑鼠移至圓餅圖與長條圖上方(若是手機用戶請改為長按)會顯示單項資料筆數;也可以點圖表附近的列表圖示,將開啟資料統計窗格查看完整計數。小地圖右上角有兩個小按鈕,分別可以切換小地圖的點位以聚集或散佈展示,和開啟 Hidy Viewer 2 展示點位地理分布(圖7)。
  • 進階篩選區 能調整多種參數,包含經緯度(範圍)、年份(範圍)、季節(單選)、主題(多選)、來源(多選)、階層(單選)、作者(單人),篩選出您需要的資料,調整好參數後,按下右下角的「更新儀表板」,整個儀表板的內容和可以下載的資料都會一起更新。💡
  • 資料預覽區 可以初步查看出現紀錄資料的樣貌,點選任一列將開啟詳細資料窗格,檢視完整內容。表格左上角的按鍵「顯示欄位」供使用者調整欲顯示的欄位;「資料下載」開放使用者一鍵下載出現紀錄資料(將以 CSV 檔案提供)。
圖7、資料儀表板展示區
圖8、資料儀表板資料預覽區

BioViewer 整合過去 ODB 生物資訊服務,提供友善的一站式查詢體驗,期望能協助使用者更有效率地獲取所需資訊!

若您對於 BioViewer 有任何疑問或建議,歡迎與我們聯絡:生物資料技術員 yhhuang15@ntu.edu.tw

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